方舟子科普全集 在线阅读
| 标题 | 出版单位 | 年份 | 书号 | 状态 |
|---|---|---|---|---|
| 《进化新解说》 | 香港天地图书有限公司 | 1997 | ISBN 962-950-245-3 | 绝版 |
| 《FL功解剖——一位海外学子的立场》 | 湖南人民出版社 | 1999.8 | ISBN 7-5438-2065-X | 绝版 |
| 《网路新语丝》（主编） | 河北人民出版社 | 2000.1 | ISBN 7-202-02682-1 | 绝版 |
| 《方舟在线》 | 北京理工大学出版社 | 2000.6 | ISBN 7-81045-702-0 | 绝版 |
| 《进化新篇章》 | 湖南教育出版社 | 2000年12月 | ISBN 7-5355-3354-X | |
| 《叩问生命——基因时代的争论》 | 天津教育出版社 | 2001年1月 | ISBN 7-5309-3278-0 | 绝版 |
| 《溃疡——直面中国学术腐败》 | 海南出版社 | 2001年6月 | ISBN 7-5443-0048-X | 绝版 |
| 《长生的幻灭——衰老之谜》 | 上海科学技术出版社 | 2002年11月 | ISBN 7-5323-6718-5 | 绝版 |
| 《江山无限——方舟子历史随笔》 | 福建人民出版社 | 2004年5月 | ISBN 7-211-04722-4 | |
| 《餐桌上的基因》 | 少年儿童出版社 | 2005年4月 | ISBN 7-5324-6503-9 | 绝版 |
| 《基因时代的恐慌与真相》 | 广西师范大学出版社 | 2005年8月 | ISBN 7-5633-5436-0 | 绝版 |
| 《寻找生命的逻辑——生物学观念的发展》 | 上海交通大学出版社 | 2005年9月 | ISBN 7-313-04005-9 | 绝版 |
| 《科学成就健康》 | 新华出版社 | 2007年1月 | ISBN 978-7-5011-7777-6 | 绝版 |
| 《批评中医》 | 中国协和医科大学出版社 | 2007年3月 | ISBN 978-7-81072-876-8 | |
| 《寻找生命的逻辑——生物学观念的发展（第二版）》 | 上海交通大学出版社 | 2007年6月 | ISBN 978-7-313-04005-3 | |
| 《食品转基因》 | 少年儿童出版社 | 2007年8月 | ISBN 978-7-5324-7295-6 | |
| 《方舟子破解世界之谜》 | 陕西师范大学出版社 | 2007年8月 | ISBN：978-7-5613-3703-5 | 绝版 |
| 《方舟子带你走近科学》 | 陕西师范大学出版社 | 2007年11月 | ISBN：978-7-5613-3805-6 | |
| 《你在吃补还是吃毒》 | 台湾八方出版社 | 2008年7月 | ISBN:978-986-7024-49-7 | |
| 《爱因斯坦信上帝吗》 | 广西科学技术出版社 | 2009年8月 | ISBN 978-7-80763-312-9/N-4 | |
| 《奇妙的植物世界》（翻译） | 广西科学技术出版社 | 2009年6月 | ISBN 978-7-80763-472-0 | |
| 《神奇的动物世界》（翻译） | 广西科学技术出版社 | 2009年6月 | ISBN 978-7-080763-473-7 | |
| 《大象为什么不长毛》 | 海豚出版社 | 2010年9月 | ISBN：978-7-5110-0327-0 |